Maternal genetic diversity of the Red-faced sheep of Covasna based on the mtDNA control region

András Gáspárdy; Enikő Mátyás; Pernille Lieng Johanson; Péter Hudák; Zsombor Wagenhoffer; Ákos Maróti-Agóts

doi:10.59913/dagr.2024.17651

András Gáspárdy
Enikő Mátyás Institute for Farm Animal Gene Preservation, National Centre for Biodiversity and Gene Conservation
Pernille Lieng Johanson Institute for Animal Breeding, Nutrition and Laboratory Animal Science, University of Veterinary Medicine Budapest
Péter Hudák Institute for Farm Animal Gene Preservation, National Centre for Biodiversity and Gene Conservation
Zsombor Wagenhoffer Institute for Animal Breeding, Nutrition and Laboratory Animal Science, University of Veterinary Medicine Budapest
Ákos Maróti-Agóts Institute for Animal Breeding, Nutrition and Laboratory Animal Science, University of Veterinary Medicine Budapest

DOI: https://doi.org/10.59913/dagr.2024.17651

Keywords: bimodal mismatch distribution, maternal origin, breed variant

Abstract

One of the variants of the Tsigai sheep is the reddish-headed and -legged, small-sized, so-called Redface Covasna. In 2014, the Institute for Farm Animal Gene Preservation brought in a small herd of these from Transylvania with the aim of national conservation of the breed.

The aim of the study is to characterize the maternal background and maternal genetic diversity of the Red-faced sheep of Covasna. For this, the nucleotide sequence of the control region (CR) of the mitochondrial genome (mtDNA) was used. The sampling was achieved from 34 individuals 2021 and 2022.

The length of the aligned CR sequences is 621 bp with the number of polymorphic base sites 88. The number of haplotypes is 30 (from haplogroups A and B, which proves its origin in Asia Minor). The value of haplotype diversity (H_d) is 0.991, and its variance is 0.010. The mean of the nucleotide diversity (π) and the average nucleotide difference per pair (k) in the investigated flock are 21.27*10^-3 and 13.21, respectively. The value of the Tajima D test (-1.4427, p > 0.10) does not indicate a lack of alleles, nor does it indicate a narrowing of the genetic diversity occurring in the history of the population.

References

BODNÁR, Á. – BERKECZI, SZ. – PÓTI, P. – EGERSZEGI, I. – PAJOR, F. (2021): Sárgafejű cigája anyajuhok tejösszetételének vizsgálata legeltetett körülmények között. Állattenyésztés és Takarmányozás 70, 298–305.

DUNKA, B. (1997): A cigája és a cikta. Állattenyésztők Lapja 25, 7.

ESZES, F. – GÁSPÁRDY, A. (1997): Ismerjük meg jobban cigájánkat! Kistermelők Lapja 41, 20.

GÁSPÁRDY, A. – ZENKE, P. – KOVÁCS, E. – ANNUS, K. – POSTA, J. – SÁFÁR, L. – MARÓTI-AGÓTS, Á. (2022): Evaluation of Maternal Genetic Background of Two Hungarian Autochthonous Sheep Breeds Coming from Different Geographical Directions. Animals 12, 218. https://doi.org/10.3390/ani12030218

HAMMOND, J. – JOHANSSON, I. – HARING, F. (1961): Handbuch der Tierzüchtung (Dritter Band: Rassenkunde). Verlag Paul Parey. Hamburg und Berlin, 194–200.

HIENDLEDER, S. – LEWALSKI, H. – WASSMUTH, R. – JANKE, A. (1998): The complete mitochondrial DNA sequence of the domestic sheep (Ovis aries) and comparison with the other major ovine haplotype. J Mol Evol 47, 441–448. https://doi.org/10.1007/PL00006401

KESZTHELYI, T. (1997): Rajtunk múlik a sorsa! Kistermelők Lapja 41(XXV), 19.

KÓSA, L. (1998): Juhtenyésztésünk és a cigája. Kistermelők Lapja 42(XXVI), 22.

KOVACS, E. (2000): Állattartás a vajdasági Doroszlón. Logos

KUKOVICS, S. (2006): A cigája juh. In: Jávor A., Kukovics S., Dunka B. (szerk.): Régi magyar juhfajták. Mezőgazda Kiadó, Budapest, 37–89.

MEADOWS, J.R.S. – LI, K. – KANTANEN, J. – TAPIO, M. – SIPOS, W. – PARDESHI, V. – GUPTA, V. – CALVO, J.H. – WHAN, V. – NORRIS, B. – KIJAS, J.W. (2005): Mitochondrial sequence reveals high levels of gene flow between sheep breeds from Asia and Europe. J Hered 96, 494–501. https://doi.org/10.1093/jhered/esi100

RODICZKY, J. (1904): A juhtenyésztés mult és jelen irányairól. Pátria Irodalmi Vállalat és Nyomdaipari Rt., Budapest, pp. 174.

ROZAS, J. – FERRER-MATA, A. – SÁNCHEZ-DELBARRIO, J.C. – GUIRAO-RICO, S. – LIBRADO, P. – RAMOS-ONSINS, S.E. – SÁNCHEZ-GRACIA, A. (2017): DnaSP 6: DNA sequence polymorphism analysis of large datasets. Mol Biol Evol 34, 3299–3302. https://doi.org/10.1093/molbev/msx248

SCHANDL, J. (1941): A cigája eredete és külsője. Magyar Állattenyésztés 5, 73–75.

SZENTKIRÁLYI, Á. (1885): A czigaja-juh. Mezőgazdasági Szemle, Magyar-Óvár, III. évf. XI. füzet

SZENTKIRÁLYI, Á. (1923): Erdély juhai, Erdély juhtenyésztése, A mult – a jelen – a jövő. Providencia Könyvnyomdai Műintézet, Cluj-Kolozsvár

TÓTH, I. (1997): Hol a helye a cigájának? Kistermelők Lapja 41(XXV), 20.

TULLY, E, – HARMAT, L. – MARÓTI-AGÓTS, Á. – ZENKE, P. – KOVÁCS, E. – GÁSPÁRDY, A. (2023): Maternal diversity of the Yellow-faced sheep of Kecskemét based on the mtDNA control region. Danub Anim Genet Resour 8, 37–48. https://doi.org/10.59913/dagr.2023.12263

ULMANSKI, S. (1922): Rumska cigaja ovca. Poljoprivredni Glasnik 2(17)

VERESS, L. (1996): Mit tud a cigája Erdélyben? (és itthon?) Magyar Mezőgazdaság 51, 19.