A Botanikai Közlemények több mint 100 éves múltra visszatekintő tudományos lap. Az 1901-ben alapított, 1902-ben Növénytani Közlemények néven először megjelenő folyóirat a Királyi Magyar Természettudományi Társulat (KMTT) 1891-ben megalakult Növénytani Szakosztályának előadásait, híreit közölte. A lap nevét 1909-ben változtatták Botanikai Közleményekre. A KMTT megszűnése után 1952-től a Magyar Biológiai Egyesület majd Társaság Botanikai Szakosztályának lapjaként jelenik meg. Jelenleg évente egy kötet két füzete kerül kiadásra.

A Botanikai Közlemények magyar vagy angol nyelven közöl a növénytudományok különböző szakterületeit (pl. flórakutatás, rendszertan, cönológia, növényföldrajz, ökológia, paleobotanika, természetvédelem, növényélettan, anatómia, szervezettan, genetika, alkalmazott kertészeti növénytan, botanikatörténet) képviselő színvonalas, eredeti kutatási eredményeket bemutató tanulmányokat, rövid közleményeket, vélemény cikkeket, valamint egy-egy tudományterületet áttekintő szemléket. Lapunk rendszeresen tájékoztat a Botanikai Szakosztály előadóüléseinek programjáról, az előadások rövid tartalmáról. A nemzetközi szakmai közvélemény tájékoztatása érdekében a magyar nyelvű közlemények címét, kulcsszavait, összefoglalóját, valamint az ábrák és táblázatok címét és feliratait angol nyelven is tartalmazza. A cikkeket két anoním lektor véleményezi.